本部之西有西藏地，為唐古特后裔所領。主持宗教者，有達賴、班禪兩喇嘛。其他世務，委之他喇嘛，號曰第巴。時有桑結者，為第巴，頗專恣。當康熙二十一年，五世達賴卒，桑結秘不發喪，自擁立六世達賴。他部之拉藏汗惡之，殺桑結，囚六世達賴，而立新六世達賴。西藏之喇嘛不悅拉藏汗，蒙古諸部亦不服新立之達賴喇嘛，因別選達賴喇嘛，奉之于甘肅西寧。準噶爾部之策妄拉布坦知之，乘機人西藏，襲殺拉藏汗，西藏喇嘛多應之。玄燁聞變，命十四子允礻是為撫遠大將軍，入西藏，擊退策妄拉布坦。凡通于準噶爾之喇嘛四百余人，悉行戮誅。舉拉藏汗之舊臣二人，使分治前藏、后藏。迎西寧之達賴喇嘛為六世達賴，西藏遂平。實康熙五十九年也。